MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY050

Total Repeats: 53

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016029	CT	3	6	34	39	0 %	50 %	0 %	50 %	347662275
2	NC_016029	CGC	2	6	99	104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
3	NC_016029	CCT	2	6	188	193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347662275
4	NC_016029	CTCTC	2	10	196	205	0 %	40 %	0 %	60 %	347662275
5	NC_016029	CCG	2	6	330	335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
6	NC_016029	CTC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347662275
7	NC_016029	AG	3	6	428	433	50 %	0 %	50 %	0 %	347662275
8	NC_016029	TGG	2	6	485	490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347662275
9	NC_016029	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347662275
10	NC_016029	CTG	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662275
11	NC_016029	ACT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662275
12	NC_016029	GCA	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662275
13	NC_016029	GCC	2	6	599	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
14	NC_016029	CA	3	6	654	659	50 %	0 %	0 %	50 %	347662275
15	NC_016029	GCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662275
16	NC_016029	CT	3	6	710	715	0 %	50 %	0 %	50 %	347662275
17	NC_016029	CCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347662275
18	NC_016029	CGC	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
19	NC_016029	TC	3	6	876	881	0 %	50 %	0 %	50 %	347662275
20	NC_016029	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662275
21	NC_016029	GCC	3	9	1396	1404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662276
22	NC_016029	AG	3	6	1408	1413	50 %	0 %	50 %	0 %	347662276
23	NC_016029	GCA	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662276
24	NC_016029	ACA	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662276
25	NC_016029	GCCCT	2	10	1660	1669	0 %	20 %	20 %	60 %	347662276
26	NC_016029	GAA	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347662277
27	NC_016029	CTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662277
28	NC_016029	AGG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347662277
29	NC_016029	AAC	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662277
30	NC_016029	TGC	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662277
31	NC_016029	AGG	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347662277
32	NC_016029	ATC	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662277
33	NC_016029	AT	3	6	2961	2966	50 %	50 %	0 %	0 %	347662278
34	NC_016029	CTT	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347662278
35	NC_016029	TTTTCA	2	12	2978	2989	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347662278
36	NC_016029	TTTA	2	8	3012	3019	25 %	75 %	0 %	0 %	347662278
37	NC_016029	AT	3	6	3048	3053	50 %	50 %	0 %	0 %	347662278
38	NC_016029	AAT	2	6	3092	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347662278
39	NC_016029	TA	3	6	3102	3107	50 %	50 %	0 %	0 %	347662278
40	NC_016029	T	6	6	3134	3139	0 %	100 %	0 %	0 %	347662278
41	NC_016029	ATT	2	6	3153	3158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347662278
42	NC_016029	CAA	2	6	3165	3170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662278
43	NC_016029	TCTT	2	8	3210	3217	0 %	75 %	0 %	25 %	347662278
44	NC_016029	T	7	7	3216	3222	0 %	100 %	0 %	0 %	347662278
45	NC_016029	ATTT	2	8	3254	3261	25 %	75 %	0 %	0 %	347662278
46	NC_016029	GAAA	2	8	3262	3269	75 %	0 %	25 %	0 %	347662278
47	NC_016029	CCA	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347662279
48	NC_016029	TGTC	2	8	4055	4062	0 %	50 %	25 %	25 %	347662279
49	NC_016029	GGC	2	6	4079	4084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347662279
50	NC_016029	CTG	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662279
51	NC_016029	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662279
52	NC_016029	GCC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662279
53	NC_016029	ACG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662279

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.